Das Civic Museum von La Spezia wurde 1873 um einen ersten Kern von Sammlungen natürlicher Naturwissenschaftler gegründet, die von Cesare Pondenzana (1840-1884), dem Vater von Giovanni Podenzana, gespendet wurden. Nur drei Monate nach seiner Gründung beherbergte das Museum mit Unterstützung des Geologen von La Spezia, Giovanni Capellini, neben den zoologischen Sammlungen auch die archäologischen Funde, die bei den Ausgrabungen der Becken und Docks des Militärarsenals zum Vorschein kamen wie einige Pergamente, geographische Karten und Dokumente zur Geschichte der Stadt. Später, um die Jahrhundertwende, gab es einen beachtlichen Aufschwung der paläo-palethnologischen Forschung in diesem Gebiet, die von bedeutenden Wissenschaftlern, darunter Giovanni Capellini selbst, durchgeführt wurde.

Das stetig wachsende Interesse an diesem Gebiet und seine älteste Geschichte führten zu sehr wichtigen archäologischen Entdeckungen. In den ersten Jahrzehnten des 20. Jahrhunderts wurde das Museum mit Stelenstatuen aus der Kupfer- und Eisenzeit bereichert. Der ständige Zufluss archäologischer, naturalistischer und ethnographischer Materialien sowie die zahlreichen Spenden von Bürgern und Gelehrten aus der Umgebung führten zu zahlreichen Änderungen der Räumlichkeiten des Museums: von den kleinen Räumen im Erdgeschoss des Civic Theatre bis hin zu größeren und größeren Räumen wie der Stadt Saal in Corso Cavour, die Räume des städtischen Gymnasiums, Palazzina Crozza, wo sich jetzt die Civic Library befindet, die Kirche und das Kloster der Clarissas, Palazzina Crozza und schließlich ihr heutiger Standort, das Castello di San Giorgio, restauriert und restauriert kehrte mit seinem neuen Layout und der Ausstellung der Civic Archaeological Collections zur Bürgerschaft zurück.

Das Museum ist Ubaldo Formentini gewidmet, der von 1923 bis 1958 Direktor der Bibliothek und des Stadtmuseums war und somit das ideale Zentrum des kulturellen Lebens von La Spezia ist. La Spezia hatte seine Autonomie als Provinz erlangt und Formentini, der einer der aktivsten Befürworter dieser Anerkennung gewesen war, wurde mit seinen besonderen Qualitäten als akuter Ermittler der Geschichte und der Gebräuche der Menschen in Lunigiana ein Vorbild und Leitfaden für die Bildung eines bürgerlichen Stolzes, der der Würde der neuen Provinzhauptstadt entspricht.