Die Basilika diente jahrhundertelang als Taufkirche. Im Jahre 1340 ließ Giovanni da Campione eine Taufkapelle errichten, die bis 1660 bestehen blieb, als der Taufritus in die Kathedrale überführt wurde. Im Jahre 1898 wurde das Baptisterium von Viginio Muzio im neugotischen Stil umgebaut. Die Statuen, die die Tugenden außerhalb der Kirche darstellen, sind original, zusammen mit der Statue des Hl. Johannes des Täufers und den im Inneren gefundenen Reliefs des Lebens Jesu.