Der Giardino dei Semplici (Garten der Einfachen) wurde im Auftrag von Cosimo I de 'Medici auf Initiative des großen Botanikers Luca Ghini gegründet und ist der älteste botanische Garten der Welt und der erste, der an eine Universität angeschlossen ist. Die pisanischen Gärten wurden in der Vergangenheit mehrmals übertragen. Während der Präfektur Luca Ghini befand sich der Garten zunächst vor der alten Werft (Arsenal) (1543-1545); anschließend während der Präfektur von Andrea Cesalpino. (1563-1595) dieses Gebiet wurde vom Ritterorden von St. Stephan gefordert und die Gärten wurden auf ein Grundstück in der Nähe der Kirche von St. Marta übertragen, wo der Name der Straße (Via del Giardino) noch an seine Anwesenheit erinnert.

Hier fand die abgeschiedene Lage, weit entfernt vom Universitätsgebäude (Sapienza) und dem schattigen Bereich, keine Zustimmung der Wissenschaftler, sodass Ferdinand während der Präfektur Giuseppe Casabona die Gärten einem dritter Garten ', endgültiger Ort in der Via S. Maria (ca. 1590).

Der Garten, ein Ort der Meditation und Forschung, besaß authentische "Mirabilia" vegetali sowie gepflanzte und getrocknete Exemplare, die von Wissenschaftlern untersucht werden konnten. Die Klassifizierung und Katalogisierung von Pflanzensorten, eine typische Aufgabe des Pisaner Gartens, wurde von frühester Zeit durch treue Zeichnungen und Stiche „aus dem Leben“ begleitet, die in Volumen und Manuskripte eingefügt wurden, die in Umlauf gebracht wurden, wodurch der nützliche Austausch zwischen Wissenschaftlern gefördert und zur Bestätigung beigetragen wurde der Botanik als moderne Wissenschaft.

Das Botanische Museum befindet sich in den Gärten. In der ersten Hälfte des 18. Jahrhunderts wurde die Fassade dieses Gebäudes renoviert und mit einem wunderlichen Design aus Muscheln und Korallen dekoriert.

Wissenschaftliche Erkundung in den Gärten wird fortgesetzt, mit Ergänzungen der Pflanzensammlung zu Lehr-, Wissenschafts- und Wissenszwecken.