Byl to nápad Cosimo I de 'Medici vybudovat loděnici v Pise pro plavidla silné toskánské flotily.Součástí širšího schématu obnovení Pisy do své starověké nádhery, po pádu do havarijního pobavení po odevzdání se Florencii v roce 1509.

V roce 1562 byl zaveden příkaz rytířů sv.Součástí tohoto plánu byla loděnice navržená společností Buontalenti.Do roku 1540 to bylo již plně funkční a v roce 1546 byla tato nová loděnice postavená společností Medicis spuštěna první Galera, která byla postavena výhradně místními řemeslníky.

Loděnice byla postavena v osmi uličkách, každý zhruba 60 metrů dlouhý, 8 metrů vysoký a 10 metrů široký.Brzy musel být dvůr zvětšen.V roce 1563 tedy musela být přemístěna nedaleká „Giardino dei Semplici“ (Lékařská bylinková zahrada).Konkurence stavitelů lodí v Livornu a Portoferraio a změny v námořní politice však brzy začala způsobovat pomalý, ale neúprosný pokles, až v polovině 18. století, pod vládou rodiny Loreny, byly budovy přizpůsobeny pro koně Dragoonsregiment.

Nyní, v zrekonstruované části loděnic budov, jsou k dispozici velmi důležité archeologické nálezy.Jedná se o vraky a předměty každodenního používání získaného ze starověkého etruského a římského přístavu.(5. století před naším letopočtem do 5. století nl) poblíž dnešního vlakového nádraží San Rossore.Tyto objekty se mají stát ohniskem budoucího muzea starověkých lodí.