Музей естественной истории Средиземноморья находится недалеко от Гражданского музея Джованни Фаттори. Он расположен в исторической вилле Хендерсон и до него можно добраться по линии CTT Nord (ранее ATL) с остановками на Виа Рома или Пьяцца Маттеотти.

Истоки музея восходят к 1929 году с приобретением богатого материала, представленного в кабинете Технического института Веспуччи; после второй мировой войны, которая привела к потере коллекции, музей был вновь открыт в муниципальном аквариуме Diacinto Cestoni, а в 1980 году он был перенесен в штаб-квартиру Villa Henderson.

Вилла принадлежала Антонио Орланди в 1762 году и позже перешла к Филиппу, Гебхарду, а затем к Уэббу Джеймсу. В 1917 году, после того, как принадлежал семье Браккини, он стал собственностью Джорджа Хендерсона, чья семья принадлежала британской общине города с конца 18-го века. После его смерти в 1934 году здание, которое в то время состояло из тридцати комнат и большого парка, перешло администрации провинции Ливорно. Сад до сих пор частично сохраняет типичную «английскую» планировку, рожденную в конце восемнадцатого века. Заслуживают внимания разновидности древесных пород, которые благодаря шестиугольному фонтану и небольшой каменной пещере с тремя небольшими арками, покрытыми спонтанной растительностью, обогащают окружающую среду, в которой доминирует вековая сосна.

Комплекс сегодня состоит из собственно виллы, на которой расположены административные помещения, и нового раздела, построенного на трех этажах, который включает 4 маршрута, разделенных на 3 выставочных зала: Sala dell'Uomo, Sala Геопалеонтология, Sala dell'Uomo nel Mediterraneo, Комната сравнительной анатомии позвоночных. Пятый путь, открытый в 2009 году, касается «Полета в природе» и предлагает обзор стратегий, разработанных растительными и животными организмами с доисторических времен до наших дней. В этом же комплексе находится планетарий и зрительный зал (более 100 мест), оснащенный самым современным оборудованием для воспроизведения звука и изображения. Внутри исторического сада находится здание, в котором расположена историко-научная библиотека: ее коллекция из примерно 5000 томов и более 400 журналов, каталогизированных и доступных общественности по предварительной записи, является отличным центром документации и базой данных. для Средиземноморья.
Также в историческом саду находится Комната беспозвоночных, посвященная множеству разновидностей живых существ, относящихся к категории беспозвоночных, водных и наземных, как примитивных, так и более развитых: часть комнаты касается морских видов (таких как губки, моллюски, иглокожие), тогда как второй сектор включает наземных членистоногих (например, паукообразные, жуки, одонаты и другие).

В Морской комнате, в дополнение к диорамам, которые реконструируют морское дно Средиземного моря, выставлена ​​серия скелетов морских китообразных, среди которых стоит образец обыкновенного кита, найденного в Пьомбино в 1990 году. Павильон, построенный специально для Воздействие на публику китообразных и напоминающее его форму в своей конструктивной архитектуре, он предлагает богатую документацию по всем видам рыб, млекопитающих, черепах и птиц Средиземного моря.

В 2003 году был открыт Центр экологического образования, состоящий из ряда лабораторий, оснащенных самым современным оборудованием: в помещениях этого многоцелевого центра, представляющего образовательную часть музея, института. Музей способен продвигать не только для провинциальной территории, но и на гораздо более широкой территории целый ряд мероприятий, направленных на развитие образования в области экологического образования: центр варьируется от ботаники до зоологии, от химии до археологии от генетики к антропологии.
Музей оборудован Лабораторией сохранения зародышевой плазмы, расширенной в 2009 году в существующей структуре, в которой банк семян основных средиземноморских видов хранится и хранится компьютеризированным способом. Деятельность, осуществляемая в этом секторе, направлена ​​прежде всего на охрану видов, находящихся под угрозой исчезновения, и имеет активные каналы обмена с другими европейскими банками зародышевой плазмы.

Существует также ботанический сад, который является внешней проекцией музейных залов. Это повторно предлагает флору Средиземноморского бассейна, с особым акцентом на провинцию Ливорно и ее архипелаг