Der früheste Hinweis auf eine Werft in Pisa stammt aus dem frühen 13. Jahrhundert, als die Werft der Stadt westlich außerhalb der Mauern errichtet wurde. Diese Werft war sowohl für den Schiffsbau als auch für die Reparatur von Galeeren bestimmt. Um die Mitte des Jahrhunderts wurden in der Nähe der Stadtmauern Befestigungsanlagen errichtet. Damals verband ein Kanal die Werft mit dem Fluss; Es befand sich wahrscheinlich in der Nähe der südwestlichen Ecke der Festungen und trat „schräg“ in ein inneres Becken ein, das von einem Rundbogenschuppen umgeben ist. Die einzige Spur davon sind die sieben Bögen, die im 13. Jahrhundert eingemauert werden können Stadtmauer im Süden. Gegen Ende des Jahrhunderts wurden mehrere befestigte Türme errichtet.

Im 14. Jahrhundert wurden offenbar einige Veränderungen vorgenommen: Die Stadtmauer wurde erhöht, der Schuppen aus dem 13. Jahrhundert wurde abgerissen und die südliche Verteidigungsmauer zog nach Norden. Der Kanal wurde in eine zentralere Position gebracht, und für die Galeeren wurden neue Schuppen mit gotischen Bögen gebaut. Dies sind die fünf Ruinenschiffe, die heute noch auf der westlichen Seite dieses Gebiets zu sehen sind.