Музей минералогии является частью, вместе с отделом геологии и палеонтологии, Музея Отделения наук о Земле Университета Павии, где хранится около 10 тысяч образцов минералов, горных пород и окаменелостей. Он также является частью недавно созданной университетской музейной системы. Нынешняя организация делится на часть систематики и региональной части и "великих чемпионов".

Первый организован по систематическому порядку Струнца, без учета места происхождения. Региональная коллекция включает минералы, типичные для каждого итальянского региона, в то время как «великие чемпионы» состоят из крупных изделий из самых разных мест.

Есть около 8000 сохранившихся минералов. Среди небольших коллекций - коллекции Val Devero, бриллиантов из Восточной Европы и дидактики для студентов. Существует также небольшая коллекция метеоритов: два имеют особую историческую ценность, так как они упали вокруг Сиены к концу 18-го века и были собраны Лаззаро Спалланцани.